ฝ่ายคณะกรรมการและเลขานุการ มีแผนกในความรับผิดชอบ 3 ส่วน ประกอบด้วย สำนักพัฒนาสหกรณ์  สำนักวิเคราะห์ข้อมูลและพัฒนาโครงการ และแผนกส่วนกลาง โดยขึ้นตรงกับผู้จัดการฝ่ายและผู้ช่วยผู้จัดการฝ่าย แบ่งหน้าที่ความรับผิดชอบ ดังนี้

1. สำนักพัฒนาสหกรณ์ มีหน้าที่จัดฝึกอบรมให้ความรู้แก่สมาชิกสหกรณ์ภาคการเกษตร ซึ่งเป็นสมาชิกของชุมนุมสหกรณ์การเกษตรแห่งประเทศไทย จำกัด (ชสท.) ทั้ง 9 เขต และจัดทำเอกสารต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้อง
   ในโครงการฝึกอบรมของ ชสท. ประกอบด้วย แผนกประชาสัมพันธ์และโสตทัศนูปกรณ์ มีหน้าที่ดูแล และประชาสัมพันธ์ข่าวสารต่าง ๆ ขององค์กรในรูปแบบวีดีโอ วีดีทัศน์ และภาพถ่าย ผ่านสื่อต่าง ๆ ทางเว็บไซต์ co-opthai.com  Facebook : ชุมนุมสหกรณ์การเกษตรแห่งประเทศไทย จำกัด (ชสท.) YouTube ของ ชสท. ชื่อช่อง Acft coopthai  ถ่ายทำ Live สด และกิจกรรมอื่น ๆ ตามที่ได้รับมอบหมายจากผู้บังคับบัญชา      
2. สำนักวิเคราะห์ข้อมูลและพัฒนาโครงการ มีหน้าที่เขียนร่างโครงการ และวิเคราะห์ข้อมูลต่าง ๆ ตามคำสั่งผู้บังคับบัญชา ประกอบด้วย แผนกศูนย์เรียนรู้ 100 ปี สหกรณ์ไทยมีหน้าที่ดูแลและให้ข้อมูลความรู้ด้านการสหกรณ์กับสหกรณ์สมาชิก นิสิต นักศึกษา และบุคคลภายนอกทั่วไป
3. แผนกส่วนกลาง ประกอบด้วย แผนกธุรการ แผนกติดตามนโยบายและเลขานุการ และแผนกประสานงานสหกรณ์ โดยแบ่งหน้าที่ความรับผิดชอบในแผนกต่าง ๆ ดังนี้
   • แผนกธุรการ มีหน้าที่ดูแลระบบสารบัญ รับ-ส่ง เอกสารต่าง ๆ ภายในฝ่ายและภายนอก ดูแลการเงิน และจัดทำเอกสารเบิกค่าใช้จ่ายต่าง ๆ รวมทั้ง จัดพิมพ์ และจัดเก็บเอกสาร ตามที่ได้รับมอบหมายจากผู้บังคับบัญชา
   • แผนกติดตามนโยบายและเลขานุการ มีหน้าที่ดูแลการจัดประชุมคณะกรรมการดำเนินการ ชสท. และการประชุมใหญ่ ชสท. โดยมีหน้าที่จัดทำเอกสารการประชุมต่าง ๆ และจัดพิมพ์เอกสารอื่น ๆ รวมทั้ง ติดต่อประสานงานกับฝ่ายต่าง ๆ ของ ชสท. และหน่วยงานภายนอก ตามที่ได้รับมอบหมายจากผู้บังคับบัญชา  
   • แผนกประสานงานสหกรณ์ มีหน้าที่จัดพิมพ์หนังสือเชิญประชุม และติดต่อประสานงานกับสหกรณ์สมาชิก